距离上次印地安那·琼斯博士的历险故事，已经过去整整19年了，斗转星移，大银幕里的虚构故事与现实的时间同步--印地安那在他教书的马歇尔大学也度过了19个年头，却被迫面临政府的施压，被大学解雇的危险……...

琼斯博士同一个上海夜总会歌手和一个名叫兰德的12岁小孩来到一个印度村庄。村落里的人们告诉他们，自从安卡拉圣石被盗走之后邪恶之神就常常骚扰这里，抢走他们的儿童。为了拯救数以百计被神秘崇拜仪式奴役的儿童及找出安卡拉圣石的秘密...

琼斯博士和他的父亲联手出击，一起追寻传说中极具神力的基督圣杯的下落，这是耶稣最后晚餐时使用过的圣杯。在意大利一所古教堂里，他们找到了线索。但发现纳粹党也在找圣杯。...